L'archivio fotografico contiene immagini storiche relative alla vita rurale della pianura bolognese fino agli anni 50 del secolo scorso.
Di particolare rilievo sono i nitrati di Antonio Pezzoli di inizio XX secolo che documentano tutte le fasi di lavorazione della canapa. Molto ricca è anche la raccolta dedicata al riso donata al Museo dalla Cooperativa Lavoratori della Terra di Bentivoglio.
Presso l'archivio è conservato il fondo "Cattedre Ambulanti di Agricoltura", composto da 1323 diapositive fotografiche
che documentano l’importanza della fotografia nell’ambito della divulgazione e della formazione, e forniscono un fondamentale strumento di indagine sulla storia della fotografia, dell’istruzione e delle tecniche agrarie. Le diapositive sono state restaurate, catalogate e digitalizzate nel 2021, sono disponibili online sul Catalogo generale dei Beni Culturali https://catalogo.beniculturali.it/search/Agent/607e032df6e493ac5308a9c0e662ae81
Il Museo conserva inoltre numerose foto, diapositive e filmati dedicati:
Gran parte del fondo VHS è stato digitalizzato ed è consultabile previo appuntamento.